在使用iThenticate进行论文查重时，确保参考文献和文档格式的准确性至关重要。系统可能会将部分或全部参考文献误标为重复，这通常是由于参考文献列表的排版或格式问题所致。此外，文档格式必须符合系统要求，包括文件类型（如doc、docx、pdf）、文件大小限制、以及去除加密和只读属性。同时，文档中的修改痕迹、批注、水印等无关信息也应被清除，以免影响查重结果的准确性。

上传论文到iThenticate进行查重时，用户应遵循明确的上传与检测流程。首先，确保上传的文稿版本与最终投稿内容完全一致。其次，根据学校或机构的要求，选择适当的检测范围，如目录、摘要、正文、参考文献等。同时，用户还需注意检测字数的限制，确保提交的论文字符数在系统允许的范围内。

iThenticate查重完成后，用户将收到详细的查重报告。为了有效管理这些报告，用户应及时下载并保存到本地计算机中，以防在线报告丢失或无法访问。

用户可能会遇到一些系统限制或特殊情况。例如，系统拥堵或临时维护可能导致暂时无法查重。针对这些情况，用户应了解并接受系统可能存在的延迟或中断，并可以通过联系工作人员寻求人工查重等解决方案。同时，用户还需了解并接受系统的退款政策，即在提交论文并开始检测后，系统将产生成本且不接受退款。

在论文查重过程中，系统可能会将注解（如脚注、尾注）或特殊排版格式误识别为重复内容，从而影响查重结果的准确性。为减少误标情况，建议用户在上传前确保注解和排版格式清晰规范；如因格式原因出现误标，可根据查重报告进行调整，或咨询技术支持以优化查重结果。

用户可以在支付检测费用后申请开具电子发票，并了解发票的开具项目（如“文献查重费”或“技术服务费”）。